在确定骨不连的治疗时，必须考虑以下因素：明确原因，骨不连的部位(具体的骨及骨内的位置)，骨不连的类型，之前的治疗，X线表现，以及一系列其他病人的具体特点。在广义上，治疗计划应包括改善局部生物学行为或/和加强其机械稳定性。常用的改善局部生物性状的治疗方法包括：去除感染灶，骨移植，骨髓移植和应用Ilizarov方法。提高机械稳定性的方法包括：钢板螺钉内固定术，髓内钉内固定和外固定架。
手术治疗是目前治疗骨不连最主要的方法，90％以上的骨不连可以通过手术治疗，且80％的病例预后良好，主要包括病变切除，合理内固定，骨折端加压，加压外固定，骨移植以及各个方法的联合应用。
内固定
牢靠的内固定对骨愈合有直接关系，应用加压钢板固定，能使骨折端紧密接触，增加纵向挤压，消除骨折端的应力，有利于毛细血管的生长和爬行，促进愈合。加压钢板可以不用外固定，从而关节和肌肉活动早，应用普通钢板则需石膏制动一段时间。
外固定
骨外固定器治疗长骨干骨不连是近年来骨不连治疗的重要进展，这种方法侵袭较少，主要适用于治疗胫骨干骨不连及骨缺损。其优点主要有：
1、加压应力在骨折端的分布较均匀；
2、具有牢稳的弹性固定及固定刚度的可调性，应力遮挡效应小；
3、不干扰骨断端的血供，利于畸形矫治；
4、使肢体能早期负重及功能锻炼，产生骨折间断性应力刺激，使骨折易于愈合。临床应用要选择可靠的骨外固定器，以双臂式为宜，其缺点为术后管理较复杂、针孔感染较多见，严重的感染将被迫拔针而终止治疗。
植骨
骨移植目前被广泛应用于治疗延迟愈合和骨不连接、骨缺损。骨移植物通过成骨作用，骨传导和骨诱导作用支持新骨的形成。目前，自体松质骨、皮质骨植骨术仍是最好的植骨材料，多取自髂骨或胫骨近端。人造骨移植是用化学方法制成一种物质，移植于骨缺损处代以植骨。人造骨没有诱导成骨作用，其骨生长机制是爬行替代过程。目前，国内对人造骨的研究多作为骨形态发生蛋白的载体来进行，已应用于临床。
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